Ganze 23 Jahre und 224 Tage übte er dieses Ehrenamt aus: Zunächst als Vorsitzender des Kuratoriums, dann als Vorsitzender des neu geschaffenen Hochschulrats. „Die Kanzler kamen und gingen und die Rektoren kamen und gingen, aber der Hochschulrat blieb“, so Hochschulpräsident Prof. Gundolf Baier. Dies zeige, welch beachtliche Leistung Herr Bauer erbrachte und welche Konstanz er für die Hochschule Schmalkalden bis ins höchste Alter in selbstloser Weise zeigte. Baier würdigte auch die ausgleichende und unaufgeregte Art, in der Hans-Joachim Bauer stets wirkte und sein bedeutendes Amt souverän ausübte. Mit großem Applaus und Standing Ovations wurde der ehemalige Hochschulratsvorsitzende zum Neujahrsempfang bedacht. Sichtlich gerührt bedankte sich Bauer für die besondere Ehrung: „Mir ist diese Zeit viel kürzer vorgekommen.“ Für ihn war es eine Zeit der fruchtbaren Zusammenarbeit mit dem Präsidium und vielen weiteren Menschen an der Hochschule. „Wir haben uns als Hochschulrat nie als Aufsichtsratsgremium verstanden“, so Bauer.
